Η ΕΟΠΕ διοργανώνει ετησίως ένα Ελληνικό Συνέδριο Ογκολογίας, το οποίο κάθε δύο χρόνια διοργανώνεται με τη συνεργασία άλλων εθνικών παρεμφερών εταιρειών, όπως με την Ελληνική Εταιρεία Ακτινοθεραπευτικής Ογκολογίας. Τα συνέδρια αυτά παρακολουθούνται από την πλειονότητα των Ελλήνων Παθολόγων Ογκολόγων, μαζί με ιατρούς άλλων συναφών ειδικοτήτων, ειδικούς επιστήμονες και φοιτητές ιατρικής.

Εκτός από τη διοργάνωση των δικών της συνεδρίων, η ΕΟΠΕ εκχωρεί την αιγίδα της σε εκδηλώσεις που άπτονται του αντικειμένου της ογκολογίας. Οι εκδηλώσεις αυτές οργανώνονται από άλλες συναφείς εταιρείες, οργανισμούς ή ακόμη και μέλη της και η εκχώρηση αιγίδας πραγματοποιείται έπειτα από απόφαση του ΔΣ της και με βάση τον Κανονισμό Χορήγησης Αιγίδας της, εξασφαλίζοντας ότι τα προγράμματα αυτών των εκδηλώσεων είναι σύμφωνα με τα δικά της υψηλά πρότυπα και προδιαγραφές.